国家基金申请成功范本(pdf 22)

     电子信息杂交策略是依据比较基因组定位结果，充分利用猪EST（expressed sequence tag, EST）数据库的信息资源，借助计算机辅助进行基因的克隆，又称为“silicon cloning”。其基本原理是利用研究深入、标记稠密的哺乳动物基因组保守功能基因的编码区序列（CDS）作为信息探针，在猪EST数据库筛选同源EST(s)(标准：长度≥100bp，同源性75%～95%) ，排除已克隆EST(s)后进行拼接，设计引物获取基因(cDNA) 全长（Altschul 等，1990；Mao等，1998；A田芳等，2000；Cirera 等，2000）。该方法的特点是：（1）是建立在生物信息学分析的基础上，进行同源性比较和计算机辅助克隆新基因，具有快速、简便、直接等优点；(2) 因为该方法在选择候选基因时有很强的目的性，是一种与定位克隆、定位候选克隆策略并列的比较候选基因法；（3）由于该方法是利用的是EST即cDNA部分序列信息，因而能够获得基因(cDNA) 全长（Liang等，2000）。
      利用电子信息杂交策略在分离猪基因中的应用才刚起步（Cirera 等，2000），但该方法在人及其它动物基因分离中已经有广泛的应用（Mao等，1998；Bolognese, 等，2000；毕安定等，2000；范玉新等，1999），由此可见，利用电子信息杂交策略分离猪基因将具有良好的应用前景，在国内开展十分必要。

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